Η εύρυθμη λειτουργία του Μουσείου καλύπτεται οικονομικά εν μέρει από τα έσοδα του συνόλου των εκπαιδευτικών δραστηριοτήτων που οργανώνει, από το πωλητήριο και τις συνδρομές μελών. Το πολύπλευρο έργο του κυρίως όμως βασίζεται στην ουσιαστική οικονομική αρωγή Ιδρυμάτων, Τραπεζών και Εταιρειών.
Το Μουσείο δεν λαμβάνει επιχορήγηση από κάποιον δημόσιο φορέα. 
Το Υπουργείο Πολιτισμού και η Γενική Γραμματεία Ολυμπιακών Αγώνων κατά περιόδους προσέφεραν συμβολική στήριξη.

Ιδαίτερη μνεία γίνεται στις εξής ευγενικές χορηγίες:

Ίδρυμα «Σταύρος Νιάρχος»
Εθνική Τράπεζα
Kraft Jacobs Suchard

Το Μουσείο ευχαριστεί θερμά τους κάτωθι χορηγούς:

Ίδρυμα Ιωάννου Φ. Κωστόπουλου 
Ίδρυμα Παναγιώτη και Έφης Μιχελή 
Ίδρυμα Α.Γ. Λεβέντη 
Ίδρυμα Μποδοσάκη 
Κοινωφελές Ίδρυμα «Αλέξανδρος Σ. Ωνάσης» 
Ίδρυμα Λίλιαν Βουδούρη

ATE Bank
Millenium Bank
Τράπεζα της Ελλάδος
Τράπεζα Κύπρου

Hellas online
Αργυρομεταλλευμάτων& Βαρυτίνης Α.Ε.Ε
ZEYΣ Xρηματιστηριακή A.X.E. E.Π.E.Y
ΙΟΛΗ Φυσικό Μεταλλικό Νερό 
Ματσούκης Α.Ε. Γραφικών Τεχνών
Μινέρβα Ελαιουργική Επιχείρηση Α.Ε.
Όμιλος Εταιρειών 3Ε
ΟΠΑΠ
Σκλαβενίτης Α.Ε.Ε.
ΦΑΓΕ Α.Ε
Amita Fun
Expose - Εκθεσιακή Αρχιτεκτονική
Faber Castell
Kraft Foods
Lavipharm A.E. 
SHELL Hellas Α.Ε
Unilever 
Warner Lambert

	​